Zatčen byl za podivných okolností, skoro jako by to bylo náhodou. Sedmého listopadu 1949 si šel Záviš Kalandra zatelefonovat ke svému příteli a švagrovi Arnoštu Ungárovi, s nímž bydlel ve stejném domě. Netušil však, že u něj provádí razii Státní bezpečnost.
A už vůbec ho nenapadlo, že na svobodu se již nikdy nepodívá a sedm měsíců poté skončí jeho život na nádvoří věznice v Praze-Pankráci.